Οι πράσινες στέγες, ειδικά οι πολυώροφες στέγες, πρέπει να προστατεύονται από τον άνεμο. Η ισχύς του ανέμου εξαρτάται τόσο από την τοπική κατανομή του ανέμου όσο και από το ύψος του κτιρίου – όσο πιο ψηλό είναι το κτίριο, τόσο μεγαλύτερη είναι η επίδραση του ανέμου στο κτίριο και στα φυτά. Ο άνεμος δρα απευθείας στα φυτά μηχανικά, σπάζοντας τα άνθη, τα φύλλα, τα κλαδιά τους. Επιπλέον, η ροή που προκαλεί ο άνεμος ξηραίνει τα φυτά, μειώνοντας την ποσότητα υγρασίας σε αυτά. Ως εκ τούτου, είναι απαραίτητο να προβλεφθούν μέτρα φυτοπροστασίας από τον άνεμο ή να φυτευτούν μεγαλύτερα φυτά.
Η πιο ενδεδειγμένη λύση, όπως έχει δείξει η πολυετής εμπειρία, είναι η δημιουργία μιας ελαφριάς, περιφραγμένης περιμέτρου από δέντρα και θάμνους. Επιπλέον, μπορούν να επιτευχθούν καλύτερα αποτελέσματα με την ανάμειξη της φύτευσης φύλλων και κωνοφόρων. Αποτελεί ένα πολυεπίπεδο ζωντανό φτερό που μπορεί να σπάσει τα ρεύματα του ανέμου και να δημιουργήσει ένα φυσικό υπόβαθρο για φυτικές συνθέσεις. Επιπλέον, η προστασία από τον αέρα παρέχεται από διακοσμητικές πέργκολες και προστατευτικές σίτες, που χρησιμεύουν ως φόντο και υποστήριξη για τα φυτά.